【翻译】本月分子253:表达复合体 Expressome

原文链接 Molecule of the Month: Expressome

表达复合体 Expressome

在细菌中,核糖体在信使RNA转录过程中开始构建蛋白质。

Expressome

表达复合体中RNA聚合酶为绿色,核糖体为蓝色,转录延长因子为紫色和洋红色。右图中,DNA编码链为黄色,反义链为橙色,mRNA为红色,tRNA为洋红色和紫色。

在我们的细胞中,转录(transcription)和翻译(translation)过程发生在两 个不同的区域:DNA在细胞核中被转录为信使RNA,信使RNA在细胞质中被翻译成 蛋白质。不同的是,细菌细胞在同一个地方完成所有的事情,这带来了两个过程 能够相互作用的可能性。然而实际上,细菌正利用了这样的好处。核糖体 (ribosome)在信使RNA刚刚转录出来的时候就开始工作,结果会拖拽着新的 mRNA并促进了该mRNA的合成。

柔韧的连接

然而在通常情况下,细菌不会简单地允许核糖体 (ribosome)撞向RNA聚合酶(RNA polymerase)。相反,它们会用转录延长 因子(transcription elongation factor)来把RNA聚合酶连接到核糖体,拉在 较近距离,但是又不会过于近。诸如NusG和NusA这些转录延长因子是柔韧地并允 许聚合酶和核糖体保持一定距离,这为许多在氨基酸被添加到蛋白质上的小的核 糖体的运动提供了空间。

工作中的表达复合体

RNA聚合酶,一个核糖体还有所有相关的分子共同形成一个“表达复合体 (expressome)”,或者“转录-翻译复合体(transcription-translation complex)”(TTC)。如PDB条目 6x9q,NusG和NusA桥接了RNA聚合酶 和核糖体的小亚基,把mRNA放到了进入核糖体的完美的位置。


碰撞复合体

可以想象,这些大的复合体非常难以研究,所以一些研究者使用了多种方法来看 到它们。如PDN条目5my1(未展示), 一个早期的研究中把RNA聚合酶被暂停,而允许核糖体碰撞RNA聚合酶。最近,别 的研究者用一个短的RNA片段来把聚合酶和核糖体连到一起构成了类似早期的碰 撞复合体的复合体,如PDB条目6ztm (下图)和PDB条目6vu3(未展示)。 对比之下,我们可以看到NusG/NusA转录延长因子(如右侧)把聚合酶和和核糖 体以一个相当不同的相对方向分开一点点。

Expressome

如左侧为碰撞的复合体,右侧为结合NusG和NusA的表达复合体。

By @Wolfson Liu in
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