设置和获取工作目录

设置工作目录可以方法进行数据读取和输出.

• setwd("MYWORKINGDIR"): 可以通过该函数设置工作目录, 功能类似 cd MYWORKINGDIR.
• getwd(): 可以获得当前的工作目录, 功能类似 pwd.
• path.expand("~"): 可以把 ~ 转为家目录的绝对路径.
• file.path(..., fsep = "/"): 构建一个文件的路径, 根据输入的文件夹名和分隔符号来构建, 也可以通过 paste() 完成, 但 file.path 的速度更快.

显示文件名或目录名

• dir() 或者 list.files(): 可以显示特定目录下的文件, 可以设置是否递归显示, 是否显示文件名前面的目录地址等, 默认显示工作目录.
• list.dirs(): 详细显示设定的目录下的所有目录和递归显示下面的文件, 相当于有 dir 做了很多复杂的显示设置, 默认显示工作目录.
• R.home(): 返回 R 的安装目录.

显示文件内容和属性

• file.show(FILE, pager = "less"): 通过使用特定的 pager 来在屏幕上显示 FILE 的内容, 不设置 pager 的话则会有类似 bash 中 cat 的功能, 直接在屏幕上打印.
• file.info(FILEORDIR): 可以显示文件或者文件夹的属性, 包括大小, 是否是文件夹, 时间, uid, gid 等等, 输出为一个 data.frame.
• file.access(FILE, mode = 1): 测试文件的属性, mode 为 4(r), 2(w), 1(x), 如果该属性为真, 则返回 0, 否则返回 -1.
• file_test("-nt",FILE1,FILE2): 测试文件1比文件2早, 选项可以是 -f (是文件) -d (是文件夹) -nt (newer than) -ot (older than).

判断文件夹或文件是否存在

• dir.exists("DIR"): 如果 DIR 存在的话, 返回 TRUE 否则返回 FALSE.
• file.exists("FILE"): 如果 FILE 存在, 则返回 TRUE, 否则返回 FALSE.

建立新文件夹或新文件

• dir.create("DIR"): 新建文件夹, showWarnings 设置是否有提醒, recursive 设置是否要递归建立各层目录, 相当于 mkdir -p, mode 设置权限 "0777".
• file.create("FILE"): 新建文件.

重命名文件与创建链接

• file.rename(FROM, TO): 把文件从 FROM 重命名为 TO.
• file.symlink(FROM, TO): 创建文件的软链接, 相当于 bash 中 ln -s.

复制, 和并, 删除文件

• file.copy(FROM, TO): 把文件 FROM 复制为 TO, 可以在文件名前加上路径.
• file.append(FILE1, FILE2): 把第二个文件加在第一个文件后面.
• file.remove(): 删除文件, 相当于 bash 中 rm, 删除成功返回 TRUE.
• unlink("FILEORDIR", recursive = F): 删除文件或者文件夹, 和 file.remove 相比支持使用通配符号.

常用组合

• 设置工作目录为上级目录

setwd(dirname(getwd()))

• 批量移动或者命名文件, 如果需要删除或者复制, 只要简单修改函数即可.

moveFiles <-function(from.vector, to.vector)
{
    apply(cbind(from.vector, to.vector),
          1,
          FUN = function(x){
              file.rename(x[1], 
                          x[2]))
          })
}